Ran Mouri - Es su mejor amiga desde la infancia, siempre se está preocupando por ella e intentando que no sufra por él. Está secretamente enamorado de ella desde que eran niños pequeños. Suele hablarle de Conan Doyle y de Sherlock Holmes. Una vez le dijo que su padre no perdía clientes por causa de él, sino por su mal desempeño como detective. A pesar de que la quiere mucho, es capaz de olvidar algún compromiso que tenga con ella o alguna promesa que le haya hecho. Aunque está profundamente enamorado de ella, nunca le ha dicho después de saber que ella también lo ama sus sentimientos. Sin embargo lo ha intentado en las veces que recobró su forma original pero volvió a ser
Shinichi y Ran cenando juntos.
Conan antes de poder expresarle lo que siente.
Yusaku Kudo/Yukiko Kudo - Son los padres de Shinichi, ellos saben el secreto de que él es Conan Edogawa, se lleva muy bien con ellos. Gracias a ellos ha desarrollado mucho su capacidad deductiva. Shinichi leía las novelas que su padre escribía con devoción. Dos ejemplos son la saga del Barón Nocturno y la novela del asesinato en el tren que jamás fue publicada. Yukiko conoce los sentimientos de Shinichi/Conan hacia Ran, e incluso ha llegado a bromear sobre que podría hacerlo añicos en una pelea. Está orgullosa de su hijo pero aun así cuando están juntos en un caso, ella no quiere contarle sus deducciones sin que él le comente las suyas antes.
Hiroshi Agasa - No es un familiar, pero está muy relacionado con toda la familia Kudo. Siempre se están ayudando mutuamente y además fue la primera persona en saber su secreto de ser Conan. Shinichi es el único que sabe que tiene una verruga con pelos en su cuerpo. Se llevan muy bien, e incluso ha sido el responsable de salvarle el pellejo en varias ocasiones en las que Ran sospechó de la verdadera identidad de Conan. Vive en la casa de al lado de la Residencia Kudo. Cuando va con la Liga Juvenil de Detectives, a veces le dice "Shinichi" a Conan, aunque los niños nunca lo notan. Shinichi pensaba que era una gran persona, pero que algunos de sus inventos eran fracasos. Esto sólo sucede al principio del anime, cuando produce dos explosiones en el primer episodio. Más adelante, crea muchos artefactos para ayudarlo e incluso desarrolló una carga de dinamita llamada "Arco Iris Tropical" la cual fue reconocida como una maravilla.
Shinichi ayudando a Agasa después de una explosión de uno de sus inventos.
Heiji Hattori - Se refiere muchas veces a Shinichi como su rival de Occidente. Cuando descubrió su secreto decidió guardar silencio. Han coincidido en muchos episodios y se ayudan para resolver casos difíciles. Al principio lo tomaba como una competencia, pero luego se han vuelto amigos y cooperan en los casos en lugar de
Shinichi y Heiji el día en que se conocieron.
competir. Muchas veces le dice Kudo delante de Ran o cosas similares, aunque después soluciona el problema, al igual que Agasa cuando le llama Shinichi.
Ai Haibara - A pesar de no haber coincidido mientras los dos estaban en su forma adulta, parece ser que Ai es la tercera persona que muestra algo más aparte de amistad con Shinichi. Es la responsable de que él se haya vuelto Conan por ser la creadora del APTX-4869; ella también fue encogida con la diferencia de que auto ingirió el veneno. Se sabe que tienen la misma edad tanto en su forma adulta como cuando son niños. Le llama Kudo en vez de decirle Conan y tampoco lo notan sus amigos, al igual que sucede con Agasa.
Juzo Megure - Megure ha trabajado con Shinichi para resolver muchos casos. Desde que resolvió con éxito su primer caso le respeta y siempre espera a que resuelva todos los casos. Megure solamente saca deducciones de lo que le informan sus agentes y/o Kogoro Mouri, y a veces también Conan. En cambio, Shinichi busca pruebas por su cuenta e informa su deducción generalmente cuando Megure está por marcharse o arrestar al sospechoso equivocado. Se conocieron en el primer caso de Shinichi casualmente, el cual fue en un avión. Al principio no quería incluirlo en la investigación por ser un "niñato". Cuando resuelve el caso, comienza a reconocer su talento y desde entonces suelen trabajar juntos.
Kaito Kid - Él también sabe el secreto de Shinichi. Solo se han encontrado una vez siendo Shinichi, son una especie de rivales que intentan adivinar quien es el más listo. Tienen un parecido casi idéntico. La primera vez que se encontraron, en realidad no se vieron cara a cara. Shinichi estaba deduciendo todos sus movimientos en un helicóptero fuera de la torre que Kaito pretendía hurtar. Una vez hubo deducido el truco que usó para aparentar que robó las manecillas del gran reloj, le disparó a la pantalla desde el helicóptero. Kid ha admitido que la policía tenía a alguien muy inteligente de su lado, refiriéndose a Kudo. Sin embargo, éste piensa que es un ladrón solamente y por lo tanto debe ser tratado como tal.
Shinichi a punto de disparar contra Kaito en su primer enfrentamiento.
Sonoko Suzuki - Es la mejor amiga de Ran. Ella solo consiguió un novio durante el anime y por lo tanto tiene envidia de Ran y Shinichi, aunque no sean novios. Aún así suele decir a la gente que ellos son novios, tal y como le contó a Heiji Hattori. Cuando habla de él con Ran, a menudo le llama "aquel detective", o "el fanático de los asesinatos" y cosas por el estilo. Aunque no le cae mal, tiene envidia del amor que tiene con Ran. En los primeros episodios, no se los muestra juntos. Sin embargo, la segunda vez que Conan vuelve a ser Shinichi, Sonoko dice "Éste como siempre, haciéndose el interesante". No le tiene mucha paciencia, pero sí un remoto afecto.
Kogoro Mouri - Al ser un detective igual que Shinichi pero de peor calidad, se le ha visto celoso de Shinichi porque él resolvía muchos casos mientras él perdía esos clientes. Desde que empieza el anime, se han encontrado solamente después de convertirse en Conan. La primera vez que volvió a ser Shinichi, Kogoro se vio algo sorprendido por su regreso, pero no le importó demasiado. La segunda vez sucedió lo mismo, por lo que se nota que Kogoro no le tiene paciencia cuando hace deducciones y quizá un poco de envidia.
Kazuha Toyama - Kazuha es la amiga de la infancia y amor platónico de Heiji Hattori. La primera vez que se encuentran teniendo Shinichi su forma adulta, no platican mucho, pero Kazuha lo mira y piensa en que es realmente guapo.
